Nota obciążeniowa, jako dokument księgowy, może podlegać VAT, jednakże zależy to od kontekstu, w jakim jest wystawiana. Zgodnie z ustawą z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz.U. 2004 nr 54 poz. 535 z późn. zm.), VAT jest należny od dostawy towarów oraz świadczenia usług, które są odpłatne. W przypadku noty obciążeniowej, jeśli dotyczy ona usług lub towarów, które są objęte opodatkowaniem VAT, to powinna być wystawiona z uwzględnieniem odpowiedniej stawki VAT.
Warto zauważyć, że nota obciążeniowa jest dokumentem, który potwierdza obciążenie drugiej strony kwotą do zapłaty, co często ma miejsce w przypadku rozliczeń między firmami. W praktyce oznacza to, że jeśli nota dotyczy kosztów, które są związane z działalnością gospodarczą, a także są związane z transakcjami, które są opodatkowane VAT, to należy zastosować odpowiednią stawkę VAT, zgodnie z art. 41 ustawy o VAT. Przykładem mogą być noty obciążeniowe wystawiane za usługi transportowe czy wynajem nieruchomości. W takich przypadkach, wystawca noty obciążeniowej ma obowiązek wykazania VAT na dokumencie oraz jego odprowadzenia do urzędów skarbowych.
W związku z tym, zaleca się konsultację z doradcą podatkowym w celu prawidłowego ustalenia obowiązków związanych z VAT w odniesieniu do konkretnej sytuacji oraz dokumentacji księgowej, aby uniknąć potencjalnych problemów z organami skarbowymi.